Сериновая/треониновая протеинкиназа/эндорибонуклеаза Инозитол-требующий фермент 1 α (IRE1α) — это фермент, который у человека кодируется геном ERN1[5][6].

ERN1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2HZ6, 3P23, 4U6R, 4Z7G, 4Z7H, 4YZC, 4YZ9, 4YZD, 5HGI

Идентификаторы
ПсевдонимыERN1, IRE1, IRE1P, IRE1a, hIRE1p, endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1
Внешние IDOMIM: 604033 MGI: 1930134 HomoloGene: 55580 GeneCards: ERN1
Расположение гена (человек)
17-я хромосома человека
Хр.17-я хромосома человека[1]
17-я хромосома человека
Расположение в геноме ERN1
Расположение в геноме ERN1
Локус17q23.3Начало64,039,080 bp[1]
Конец64,130,819 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
11-я хромосома мыши
Хр.11-я хромосома мыши[2]
11-я хромосома мыши
Расположение в геноме ERN1
Расположение в геноме ERN1
Локус11|11 E1Начало106,285,476 bp[2]
Конец106,378,678 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_152461
NM_001433

NM_023913

RefSeq (белок)

NP_001424

NP_076402

Локус (UCSC)Chr 17: 64.04 – 64.13 MbChr 11: 106.29 – 106.38 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция

править

Белок, кодируемый у человека геном ERN1 — это белок, участвующий в каскаде внутриклеточной передачи сигнала от эндоплазматического ретикулума клетки к её ядру. Он является человеческим гомологом белка IRE1 дрожжей. Он обладает встроенной двоякой ферментативной активностью — он является одновременно и сериновой/треониновой протеинкиназой, и эндорибонуклеазой[6].

Одна из основных функций этого белка заключается в изменении экспрессии ряда генов в ответ на стрессовые сигналы, поступающие от эндоплазматического ретикулума (прежде всего — в ответ на накопление в эндоплазматическом ретикулуме несвёрнутых или неправильно свёрнутых белков)[6].

У гена, кодирующего этот белок, обнаружены два альтернативных варианта его сплайсинга, кодирующие две разные изоформы этого белка[6].

Клиническое значение

править

Поскольку белок IRE1α (он же белок ERN1) является одним из основных сенсоров накопления несвёрнутых или неправильно свёрнутых белков в клетке, а также одним из первых звеньев в каскаде, запускающем генерацию внутриклеточного ответа на накопление в клетке несвёрнутых или неправильно свёрнутых белков, то существуют предположения, что нарушение функции этого белка может играть роль в этиологии и/или в механизмах патогенеза различных нейродегенеративных заболеваний, при которых происходит избыточное накопление в клетке токсичных для неё патологических белков, таких, как бета-амилоид, альфа-синуклеин[7].

В частности, предполагается, что нарушение внутриклеточной передачи сигнала через каскад IRE1α играет роль в патогенезе болезни Альцгеймера[8], болезни Паркинсона[9] и бокового амиотрофического склероза[10][11].

Взаимодействия с другими белками клетки

править

Белок IRE1α активно взаимодействует с белками теплового шока, в частности, с 90-килодальтонным цитоплазматическим белком Hsp90α (Heat Shock Protein 90 alpha) а также Hsp70 (BiP, он же GRP-78) [12]. При этом взаимодействие с белком Hsp90α стабилизирует белок IRE1α[13]. Когда концентрация несвёрнутых белков не превышена, люминальный домен IRE1 связан с белком-шапероном BiP. Увеличение концентрации несвёрнутых белков может привести к диссоциации комплекса IRE1:BiP вследствие конкуренции за BiP между ними и IRE1 (так как BiP, будучи шапероном, может связываться с несвернутыми белками). После распада комплекса IRE1:BiP молекулы IRE1 олигомеризуются, аутофосфорилируются и становятся активными эндорибонуклеазами, причем для эндорибонуклеазной активности IRE1 должен находиться по крайнем мере в димерной форме.

Примечания

править
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000178607 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020715 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Tirasophon W, Welihinda AA, Kaufman RJ (June 1998). "A stress response pathway from the endoplasmic reticulum to the nucleus requires a novel bifunctional protein kinase/endoribonuclease (Ire1p) in mammalian cells". Genes & Development. 12 (12): 1812—1824. doi:10.1101/gad.12.12.1812. PMC 316900. PMID 9637683.
  6. 1 2 3 4 Entrez Gene: ERN1 endoplasmic reticulum to nucleus signalling 1.
  7. Kurtishi A, Rosen B, Patil KS, Alves GW, Møller SG (May 2019). "Cellular Proteostasis in Neurodegeneration". Molecular Neurobiology. 56 (5): 3676—3689. doi:10.1007/s12035-018-1334-z. PMID 30182337.
  8. Duran-Aniotz C, Cornejo VH, Espinoza S, Ardiles ÁO, Medinas DB, Salazar C, et al. (September 2017). "IRE1 signaling exacerbates Alzheimer's disease pathogenesis". Acta Neuropathologica. 134 (3): 489—506. doi:10.1007/s00401-017-1694-x. PMID 28341998.
  9. Yan C, Liu J, Gao J, Sun Y, Zhang L, Song H, et al. (October 2019). "IRE1 promotes neurodegeneration through autophagy-dependent neuron death in the Drosophila model of Parkinson's disease". Cell Death & Disease. 10 (11): 800. doi:10.1038/s41419-019-2039-6. PMC 6805898. PMID 31641108.
  10. Montibeller L, de Belleroche J (September 2018). "Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and Alzheimer's disease (AD) are characterised by differential activation of ER stress pathways: focus on UPR target genes". Cell Stress & Chaperones. 23 (5): 897—912. doi:10.1007/s12192-018-0897-y. PMC 6111088. PMID 29725981.
  11. Chen D, Wang Y, Chin ER (2015-05-18). "Activation of the endoplasmic reticulum stress response in skeletal muscle of G93A*SOD1 amyotrophic lateral sclerosis mice". Frontiers in Cellular Neuroscience. 9: 170. doi:10.3389/fncel.2015.00170. PMC 4435075. PMID 26041991.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  12. A. Bertolotti, Y. Zhang, L. M. Hendershot, H. P. Harding, D. Ron. Dynamic interaction of BiP and ER stress transducers in the unfolded-protein response // Nature Cell Biology. — 2000-06. — Т. 2, вып. 6. — С. 326–332. — ISSN 1465-7392. — doi:10.1038/35014014. Архивировано 7 августа 2022 года.
  13. Marcu MG, Doyle M, Bertolotti A, Ron D, Hendershot L, Neckers L (December 2002). "Heat shock protein 90 modulates the unfolded protein response by stabilizing IRE1alpha". Molecular and Cellular Biology. 22 (24): 8506—8513. doi:10.1128/MCB.22.24.8506-8513.2002. PMC 139892. PMID 12446770.