SLAMF6

SLAMF6
SLAMF6
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2IF7
Идентификаторы
Псевдонимы	SLAMF6, CD352, KALI, KALIb, Ly108, NTB-A, NTBA, SF2000, SLAM family member 6
Внешние ID	OMIM: 606446 MGI: 1353620 HomoloGene: 49945 GeneCards: SLAMF6
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	1-я хромосома человека
Конец	160,523,262 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	1-я хромосома мыши
Конец	171,780,737 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	mucosa of transverse colon;
	Наибольшая экспрессия в
	subcutaneous adipose tissue;
	Дополнительные справочные данные
	н/д
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание с белками плазмы;
Компонент клетки	часть мембраны; клеточная мембрана; экзосома; мембрана;
Биологический процесс	natural killer cell proliferation; immune system process; positive regulation of interferon-gamma production; positive regulation of interleukin-17 production; врождённый иммунитет; positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; adaptive immune response; T-helper 17 cell lineage commitment; regulation of immune response; natural killer cell differentiation;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	114836
	30925
	ENSG00000162739
	ENSMUSG00000015314
	Q96DU3
	Q9ET39
	NM_052931; NM_001184714; NM_001184715; NM_001184716
	NM_030710; NM_001347186; NM_001347187
	NP_001171643; NP_001171644; NP_001171645; NP_443163
	NP_001334115; NP_001334116; NP_109635
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

SLAMF6 — мембранный белок, продукт гена человека SLAMF6^[5]^[6]. Входит в семейство сигнальных лимфоцитарных молекул активации (англ. Signaling lymphocytic activation molecule, SLAM).

Описание

Белок относится к трансмембранным белкам 1-го типа подсемейства CD2 суперсемейства иммуноглобулинов. Эспрессирован на естественных киллерах, T- и B-лимфицитах. После фосфорилирования связывается с SH2D1A, а также с SH2-домен-содержащими фосфатазами SHP. Функционирует как ко-рецептор, играющий роль в активации естественных киллеров. Опосредует ингибиторный сигнал в естественных киллерах при X-ассоциированном лимфопролиферативном синдроме (болезнь Дункана).

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162739 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015314 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Bottino C., Falco M., Parolini S., Marcenaro E., Augugliaro R., Sivori S., Landi E., Biassoni R., Notarangelo L.D., Moretta L., Moretta A. NTB-A [correction of GNTB-A], a novel SH2D1A-associated surface molecule contributing to the inability of natural killer cells to kill Epstein-Barr virus-infected B cells in X-linked lymphoproliferative disease (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2001. — August (vol. 194, no. 3). — P. 235—246. — doi:10.1084/jem.194.3.235. — PMID 11489943. — PMC 2193462.
↑ Entrez Gene: SLAMF6 SLAM family member 6 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

Литература

Claus M., Meinke S., Bhat R., Watzl C. Regulation of NK cell activity by 2B4, NTB-A and CRACC. (англ.) // Frontiers in Bioscience^[англ.] : journal. — Frontiers in Bioscience^[англ.], 2007. — Vol. 13, no. 13. — P. 956—965. — doi:10.2741/2735. — PMID 17981603.
Hercend T., Meuer S., Brennan A., etal. Natural killer-like function of activated T lymphocytes: differential blocking effects of monoclonal antibodies specific for a 90-kDa clonotypic structure (англ.) // Cell. Immunol. : journal. — 1984. — Vol. 86, no. 2. — P. 381—392. — doi:10.1016/0008-8749(84)90393-9. — PMID 6610481.
Kong G., Dalton M., Wardenburg J.B., etal. Distinct tyrosine phosphorylation sites in ZAP-70 mediate activation and negative regulation of antigen receptor function (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 9. — P. 5026—5035. — PMID 8756661. — PMC 231504.
Lee Y.J., Luisiri P., Clark M.R. A novel complex, p40/42, is constitutively associated with the B cell antigen receptor and phosphorylated upon receptor stimulation (англ.) // J. Immunol.^[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 157, no. 9. — P. 3828—3837. — PMID 8892612.
Gray C.W., Ward R.V., Karran E., etal. Characterization of human HtrA2, a novel serine protease involved in the mammalian cellular stress response (англ.) // Eur. J. Biochem.^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 267, no. 18. — P. 5699—5710. — doi:10.1046/j.1432-1327.2000.01589.x. — PMID 10971580.
Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Del Valle J.M., Engel P., Martín M. The cell surface expression of SAP-binding receptor CD229 is regulated via its interaction with clathrin-associated adaptor complex 2 (AP-2) (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 19. — P. 17430—17437. — doi:10.1074/jbc.M301569200. — PMID 12621057.
Tangye S.G., Nichols K.E., Hare N.J., van de Weerdt B.C. Functional requirements for interactions between CD84 and Src homology 2 domain-containing proteins and their contribution to human T cell activation (англ.) // J. Immunol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 171, no. 5. — P. 2485—2495. — doi:10.4049/jimmunol.171.5.2485. — PMID 12928397.
Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E., etal. The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment (англ.) // Genome Res. : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
Valdez P.A., Wang H., Seshasayee D., etal. NTB-A, a new activating receptor in T cells that regulates autoimmune disease (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2004. — Vol. 279, no. 18. — P. 18662—18669. — doi:10.1074/jbc.M312313200. — PMID 14988414.
Flaig R.M., Stark S., Watzl C. Cutting edge: NTB-A activates NK cells via homophilic interaction (англ.) // J. Immunol.^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 11. — P. 6524—6527. — doi:10.4049/jimmunol.172.11.6524. — PMID 15153464.
Zhang Z., Henzel W.J. Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites (англ.) // Protein Sci.^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 13, no. 10. — P. 2819—2824. — doi:10.1110/ps.04682504. — PMID 15340161. — PMC 2286551.
Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., etal. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Stark S., Watzl C. 2B4 (CD244), NTB-A and CRACC (CS1) stimulate cytotoxicity but no proliferation in human NK cells (англ.) // Int. Immunol.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 18, no. 2. — P. 241—247. — doi:10.1093/intimm/dxh358. — PMID 16410313.
Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., etal. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
Eissmann P., Watzl C. Molecular analysis of NTB-A signaling: a role for EAT-2 in NTB-A-mediated activation of human NK cells (англ.) // J. Immunol.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 177, no. 5. — P. 3170—3177. — doi:10.4049/jimmunol.177.5.3170. — PMID 16920955.
Cao E., Ramagopal U.A., Fedorov A., etal. NTB-A receptor crystal structure: insights into homophilic interactions in the signaling lymphocytic activation molecule receptor family (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 25, no. 4. — P. 559—570. — doi:10.1016/j.immuni.2006.06.020. — PMID 17045824.
Banerjee P., Feuer G., Barker E. Human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) p12I down-modulates ICAM-1 and -2 and reduces adherence of natural killer cells, thereby protecting HTLV-1-infected primary CD4+ T cells from autologous natural killer cell-mediated cytotoxicity despite the reduction of major histocompatibility complex class I molecules on infected cells (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 81, no. 18. — P. 9707—9717. — doi:10.1128/JVI.00887-07. — PMID 17609265. — PMC 2045425.

[refGRCh38EnsemblENSG00000162739-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000162739 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000015314-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015314 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11489943-5] Bottino C., Falco M., Parolini S., Marcenaro E., Augugliaro R., Sivori S., Landi E., Biassoni R., Notarangelo L.D., Moretta L., Moretta A. NTB-A [correction of GNTB-A], a novel SH2D1A-associated surface molecule contributing to the inability of natural killer cells to kill Epstein-Barr virus-infected B cells in X-linked lymphoproliferative disease (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2001. — August (vol. 194, no. 3). — P. 235—246. — doi:10.1084/jem.194.3.235. — PMID 11489943. — PMC 2193462.

[entrez-6] Entrez Gene: SLAMF6 SLAM family member 6 (неопр.). Архивировано 5 декабря 2010 года.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]