Белок репарации двойных разрывов нитей MRE11A — белок, кодируемый у человека геном MRE11A[5].

MRE11A
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

3T1I

Идентификаторы
ПсевдонимыMRE11, ATLD, HNGS1, MRE11B, MRE11A, MRE11 homolog A, double strand break repair nuclease, MRE11 homolog, double strand break repair nuclease
Внешние IDOMIM: 600814 MGI: 1100512 HomoloGene: 4083 GeneCards: MRE11
Расположение гена (человек)
11-я хромосома человека
Хр.11-я хромосома человека[1]
11-я хромосома человека
Расположение в геноме MRE11
Расположение в геноме MRE11
Локус11q21Начало94,415,570 bp[1]
Конец94,493,885 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
9-я хромосома мыши
Хр.9-я хромосома мыши[2]
9-я хромосома мыши
Расположение в геноме MRE11
Расположение в геноме MRE11
Локус9|9 A2Начало14,695,950 bp[2]
Конец14,748,419 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_005590
NM_005591
NM_001330347

NM_018736
NM_001310728

RefSeq (белок)

NP_001317276
NP_005581
NP_005582

NP_001297657
NP_061206

Локус (UCSC)Chr 11: 94.42 – 94.49 MbChr 9: 14.7 – 14.75 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Функция

править

Этот ген кодирует ядерный белок, участвующий в гомологичной рекомбинации, теломере обслуживания длины, и репарации двойных разрывов ДНК. Сам по себе, белок имеет от 3' до 5' экзонуклеазную и эндонуклеазную активности. Белок образует комплекс с гомологом Rad50; этот комплекс необходим для негомологичного соединения концов ДНК и имеет увеличенную одноцепочечной ДНК-эндонуклеазу, и от 3' до 5' экзонуклеазную активность. В сочетании с ДНК -лигазой, этот белок способствует присоединению некомплементарных концов in vitro с использованием коротких гомологов вблизи концов фрагментов ДНК. Этот ген имеет псевдоген на хромосоме 3. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипции, кодирующих различные изоформы[6].

Ортологи MRE11A

править

Mre11, ортолог человеческого MRE11A, происходит от прокариот архей Sulfolobus acidocaldarius[англ.] [7]. В этом организме белок Mre11 взаимодействует с белком Rad50 и, кажется, играет активную роль в репарации повреждений ДНК, экспериментально созданных гамма-излучением[7]. Кроме того, во время мейоза в эукариотической протисте Tetrahymena Mre11 требуется для репарации повреждений ДНК, в данном случае двойных разрывов[8], с помощью процесса, который, вероятно, включает в себя гомологичную рекомбинацию. Эти наблюдения показывают, что человеческий MRE11A происходит от прокариотических и протистических предков белков Mre11, которые играли роль в начале процесса репарации повреждений ДНК.

Сверхэкспрессия MRE11 при раке

править

MRE11 играет важную роль в микрогомологичном соединении концов, поддержании длины теломер и репарации двойных разрывов ДНК. Это один из 6 ферментов, необходимых при ошибке пути репарации ДНК[9]. MRE11 сверхэкспрессируется при раке молочной железы[10].

При раке очень часто недостаёт экспрессии одного или более генов репарации ДНК, но сверхэкспрессия генов репарации ДНК при этом меньше обычной. Например, по крайней мере, 36 ферментов репарации ДНК, при мутационных нарушениях в клетках зародышевой линии, вызывают повышенный риск рака (наследственных синдромов рака[англ.])[11]. Аналогично, по крайней мере, 12 генов репарации ДНК, как было установлено, эпигенетически репрессированы в одном или нескольких видах рака[11]. Как правило, недостаточная экспрессии ферментов репарации ДНК приводит к увеличению не репарированных повреждений ДНК, которые посредством ошибки репликации приводят к мутациям и раку. Тем не менее, опосредованная MRE11 репарация MMEJ весьма неточна, так что в этом случае сверхэкспрессия, а не обычная экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Взаимодействия

править

MRE11A, как было выявлено, взаимодействует с:

См. также

править

Примечания

править
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000020922 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031928 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Petrini J.H., Walsh M.E., DiMare C., Chen X.N., Korenberg J.R., Weaver D.T. Isolation and characterization of the human MRE11 homologue (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 1996. — February (vol. 29, no. 1). — P. 80—6. — doi:10.1006/geno.1995.1217. — PMID 8530104.
  6. Entrez Gene: MRE11A MRE11 meiotic recombination 11 homolog A (S. cerevisiae).
  7. 1 2 Quaiser A., Constantinesco F., White M.F., Forterre P., Elie C. The Mre11 protein interacts with both Rad50 and the HerA bipolar helicase and is recruited to DNA following gamma irradiation in the archaeon Sulfolobus acidocaldarius (англ.) // BMC Mol. Biol. : journal. — 2008. — Vol. 9. — P. 25. — doi:10.1186/1471-2199-9-25. — PMID 18294364. — PMC 2288612.
  8. Lukaszewicz A., Howard-Till R.A., Novatchkova M., Mochizuki K., Loidl J. MRE11 and COM1/SAE2 are required for double-strand break repair and efficient chromosome pairing during meiosis of the protist Tetrahymena (англ.) // Chromosoma : journal. — 2010. — October (vol. 119, no. 5). — P. 505—518. — doi:10.1007/s00412-010-0274-9. — PMID 20422424.
  9. Sharma S., Javadekar S.M., Pandey M., Srivastava M., Kumari R., Raghavan S.C. Homology and enzymatic requirements of microhomology-dependent alternative end joining (англ.) // Cell Death Dis : journal. — 2015. — Vol. 6. — P. e1697. — doi:10.1038/cddis.2015.58. — PMID 25789972.
  10. Yuan S.S., Hou M.F., Hsieh Y.C., Huang C.Y., Lee Y.C., Chen Y.J., Lo S. Role of MRE11 in cell proliferation, tumor invasion, and DNA repair in breast cancer (англ.) // J. Natl. Cancer Inst.[англ.] : journal. — 2012. — Vol. 104, no. 19. — P. 1485—1502. — doi:10.1093/jnci/djs355. — PMID 22914783.
  11. 1 2 Bernstein C, Prasad AR, Nfonsam V, Bernstein H. (2013). DNA Damage, DNA Repair and Cancer, New Research Directions in DNA Repair, Prof. Clark Chen (Ed.), ISBN 978-953-51-1114-6, InTech, http://www.intechopen.com/books/new-research-directions-in-dna-repair/dna-damage-dna-repair-and-cancer Архивная копия от 24 сентября 2015 на Wayback Machine
  12. Kim S.T., Lim D.S., Canman C.E., Kastan M.B. Substrate specificities and identification of putative substrates of ATM kinase family members (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 53. — P. 37538—37543. — doi:10.1074/jbc.274.53.37538. — PMID 10608806.
  13. 1 2 3 4 Wang Y., Cortez D., Yazdi P., Neff N., Elledge S.J., Qin J. BASC, a super complex of BRCA1-associated proteins involved in the recognition and repair of aberrant DNA structures (англ.) // Genes Dev. : journal. — 2000. — Vol. 14, no. 8. — P. 927—939. — PMID 10783165. — PMC 316544.
  14. 1 2 Chiba N., Parvin J.D. Redistribution of BRCA1 among four different protein complexes following replication blockage (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 42. — P. 38549—38554. — doi:10.1074/jbc.M105227200. — PMID 11504724.
  15. Paull T.T., Cortez D., Bowers B., Elledge S.J., Gellert M. Direct DNA binding by Brca1 (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 11. — P. 6086—6091. — doi:10.1073/pnas.111125998. — PMID 11353843. — PMC 33426.
  16. Zhong Q., Chen C.F., Li S., Chen Y., Wang C.C., Xiao J., Chen P.L., Sharp Z.D., Lee W.H. Association of BRCA1 with the hRad50-hMre11-p95 complex and the DNA damage response (англ.) // Science : journal. — 1999. — Vol. 285, no. 5428. — P. 747—750. — doi:10.1126/science.285.5428.747. — PMID 10426999.
  17. 1 2 Goedecke W., Eijpe M., Offenberg H.H., van Aalderen M., Heyting C. Mre11 and Ku70 interact in somatic cells, but are differentially expressed in early meiosis (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 1999. — Vol. 23, no. 2. — P. 194—198. — doi:10.1038/13821. — PMID 10508516.
  18. Xu X., Stern D.F. NFBD1/MDC1 regulates ionizing radiation-induced focus formation by DNA checkpoint signaling and repair factors (англ.) // The FASEB Journal[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology[англ.], 2003. — Vol. 17, no. 13. — P. 1842—1848. — doi:10.1096/fj.03-0310com. — PMID 14519663.
  19. 1 2 Trujillo K.M., Yuan S.S., Lee E.Y., Sung P. Nuclease activities in a complex of human recombination and DNA repair factors Rad50, Mre11, and p95 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1998. — Vol. 273, no. 34. — P. 21447—21450. — doi:10.1074/jbc.273.34.21447. — PMID 9705271.
  20. Cerosaletti K.M., Concannon P. Nibrin forkhead-associated domain and breast cancer C-terminal domain are both required for nuclear focus formation and phosphorylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2003. — Vol. 278, no. 24. — P. 21944—21951. — doi:10.1074/jbc.M211689200. — PMID 12679336.
  21. Matsuzaki K., Shinohara A., Shinohara M. Forkhead-associated domain of yeast Xrs2, a homolog of human Nbs1, promotes nonhomologous end joining through interaction with a ligase IV partner protein, Lif1 (англ.) // Genetics : journal. — 2008. — Vol. 179, no. 1. — P. 213—225. — doi:10.1534/genetics.107.079236. — PMID 18458108. — PMC 2390601.
  22. Desai-Mehta A., Cerosaletti K.M., Concannon P. Distinct functional domains of nibrin mediate Mre11 binding, focus formation, and nuclear localization (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 2001. — Vol. 21, no. 6. — P. 2184—2191. — doi:10.1128/MCB.21.6.2184-2191.2001. — PMID 11238951. — PMC 86852.
  23. Dolganov G.M., Maser R.S., Novikov A., Tosto L., Chong S., Bressan D.A., Petrini J.H. Human Rad50 is physically associated with human Mre11: identification of a conserved multiprotein complex implicated in recombinational DNA repair (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 9. — P. 4832—4841. — PMID 8756642. — PMC 231485.
  24. Zhu X.D., Küster B., Mann M., Petrini J.H., de Lange T. Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2000. — Vol. 25, no. 3. — P. 347—352. — doi:10.1038/77139. — PMID 10888888.

Литература

править