ARHGAP29

ARHGAP29 — ген, расположенный на первой хромосоме человека в позиции 1p22, который кодирует Rho ГТФазно активируемый белок (GAP) 29,^[1] белок, который опосредует циклическое регулирование небольших, связывающих ГТФ белков, таких как RhoA^[2].

Функция

ARHGAP29 экспрессируется в развивающемся лице и может действовать в каскаде реакций ниже белка IRF6, влияя на черепно-лицевое развитие^[3].

Структура

ARHGAP29 содержит четыре домена, включая биспиральную область, взаимодействующую с Rap2,^[4] домен С1, область Rho ГТФазный домен и небольшую С-терминальную область, которая взаимодействует с PTPL1^[2].

Клиническое значение

Исследования генома и мета-анализ^[5] показали связь локуса 1p22, содержащий ARHGAP29 с несиндромальной заячьей губой/волчьей пастью^[6]. Последующие исследования^[3] определили варианты редкого кодирования, включая нонсенс-мутации и сдвиг рамки считывания у пациентов с несиндромной заячьей губой/волчьей пастью. Вывод о роли ARHGAP29 в черепно-лицевом развитии был сделан после того как у смежного гена ABCA4 не хватило функциональных или экспрессивных данных для его поддержки в качестве этиологического гена для несиндромной заячьей губы/волчьей пасти, хотя однонуклеотидный полиморфизм в гене ABCA4 был связан с этим заболеванием.

Примечания

↑ Heasman SJ, Ridley AJ. 2008. Mammalian Rho GTPases: new insights into their functions from in vivo studies. Nat Rev Mol Cell Biol 9(9) 690—701.
↑ ¹ ² Saras J, Franzen P, Aspenstrom P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH. 1997. A novel GTPase-activating protein for Rho interacts with a PDZ domain of the protein-tyrosine phosphatase PTPL1" J Biol Chem 272(39) 24333-24338.
↑ ¹ ² Leslie, EJ; Mansilla M. A., Biggs L. C., Schuette K., Bullard S., Cooper M., Dunnwald M., Lidral A. C., Marazita M. L., Beaty T. H., Murray J. C. Expression and mutation analyses implicate ARHGAP29 as the etiologic gene for the cleft lip with or without cleft palate locus identified by genome-wide association on chromosome 1p22 (англ.) // Birth Defects Research Part A: Clinical and Molecular Teratology : journal. — 2012. — Vol. 94. — P. 934—942. — doi:10.1002/bdra.23076. — PMID 23008150.
↑ Myagmar BE, Umikawa M, Asato T, Taira K, Oshiro M, Hino A, Takei K, Uezato H, Kariya K. 2005. PARG1, a protein-tyrosine phosphatase-associated RhoGAP, as a putative Rap2 effector" Biochem Biophys Res Commun 329(3) 1046—1052.
↑ Ludwig, KU; Mangold E., Herms S., Nowak S., Reutter H., Paul A., Becker J., Herberz R., AlChawa T., Nasser E., Böhmer A. C., Mattheisen M., Alblas M. A., Barth S., Kluck N., Lauster C., Braumann B., Reich R. H., Hemprich A., Pötzsch S., Blaumeiser B., Daratsianos N., Kreusch T., Murray J. C., Marazita M. L., Ruczinski I., Scott A. F., Beaty T. H., Kramer F. J., Wienker T. F., Steegers-Theunissen R. P., Rubini M., Mossey P. A., Hoffmann P., Lange C., Cichon S., Propping P., Knapp M., Nöthen M. M. Genome-wide meta-analyses of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate identify six new risk loci (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2012. — Vol. 44, no. 9. — P. 968—971. — doi:10.1038/ng.22360. — PMID 22863734.
↑ Beaty, TH; Murray J. C., Marazita M. L., Munger R. G., Ruczinski I., Hetmanski J. B., Liang K. Y., Wu T., Murray T., Fallin M. D., Redett R. A., Raymond G., Schwender H., Jin S. C., Cooper M. E., Dunnwald M., Mansilla M. A., Leslie E., Bullard S., Lidral A. C., Moreno L. M., Menezes R., Vieira A. R., Petrin A., Wilcox A. J., Lie R. T., Jabs E. W., Wu-Chou Y. H., Chen P. K., Wang H., Ye X., Huang S., Yeow V., Chong S. S., Jee S. H., Shi B., Christensen K., Melbye M., Doheny K. F., Pugh E. W., Ling H., Castilla E. E., Czeizel A. E., Ma L., Field L. L., Brody L., Pangilinan F., Mills J. L., Molloy A. M., Kirke P. N., Scott J. M., Arcos-Burgos M., Scott A. F. A genome-wide association study of cleft lip with and without cleft palate identifies risk variants near MAFB and ABCA4. (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2010. — Vol. 42, no. 6. — P. 525—529. — doi:10.1038/ng.580. — PMID 20436469. — PMC 2941216.

[1] Heasman SJ, Ridley AJ. 2008. Mammalian Rho GTPases: new insights into their functions from in vivo studies. Nat Rev Mol Cell Biol 9(9) 690—701.

[Saras_J_1997-2] ¹ ² Saras J, Franzen P, Aspenstrom P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH. 1997. A novel GTPase-activating protein for Rho interacts with a PDZ domain of the protein-tyrosine phosphatase PTPL1" J Biol Chem 272(39) 24333-24338.

[Leslie-3] ¹ ² Leslie, EJ; Mansilla M. A., Biggs L. C., Schuette K., Bullard S., Cooper M., Dunnwald M., Lidral A. C., Marazita M. L., Beaty T. H., Murray J. C. Expression and mutation analyses implicate ARHGAP29 as the etiologic gene for the cleft lip with or without cleft palate locus identified by genome-wide association on chromosome 1p22 (англ.) // Birth Defects Research Part A: Clinical and Molecular Teratology : journal. — 2012. — Vol. 94. — P. 934—942. — doi:10.1002/bdra.23076. — PMID 23008150.

[4] Myagmar BE, Umikawa M, Asato T, Taira K, Oshiro M, Hino A, Takei K, Uezato H, Kariya K. 2005. PARG1, a protein-tyrosine phosphatase-associated RhoGAP, as a putative Rap2 effector" Biochem Biophys Res Commun 329(3) 1046—1052.

[5] Ludwig, KU; Mangold E., Herms S., Nowak S., Reutter H., Paul A., Becker J., Herberz R., AlChawa T., Nasser E., Böhmer A. C., Mattheisen M., Alblas M. A., Barth S., Kluck N., Lauster C., Braumann B., Reich R. H., Hemprich A., Pötzsch S., Blaumeiser B., Daratsianos N., Kreusch T., Murray J. C., Marazita M. L., Ruczinski I., Scott A. F., Beaty T. H., Kramer F. J., Wienker T. F., Steegers-Theunissen R. P., Rubini M., Mossey P. A., Hoffmann P., Lange C., Cichon S., Propping P., Knapp M., Nöthen M. M. Genome-wide meta-analyses of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate identify six new risk loci (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2012. — Vol. 44, no. 9. — P. 968—971. — doi:10.1038/ng.22360. — PMID 22863734.

[6] Beaty, TH; Murray J. C., Marazita M. L., Munger R. G., Ruczinski I., Hetmanski J. B., Liang K. Y., Wu T., Murray T., Fallin M. D., Redett R. A., Raymond G., Schwender H., Jin S. C., Cooper M. E., Dunnwald M., Mansilla M. A., Leslie E., Bullard S., Lidral A. C., Moreno L. M., Menezes R., Vieira A. R., Petrin A., Wilcox A. J., Lie R. T., Jabs E. W., Wu-Chou Y. H., Chen P. K., Wang H., Ye X., Huang S., Yeow V., Chong S. S., Jee S. H., Shi B., Christensen K., Melbye M., Doheny K. F., Pugh E. W., Ling H., Castilla E. E., Czeizel A. E., Ma L., Field L. L., Brody L., Pangilinan F., Mills J. L., Molloy A. M., Kirke P. N., Scott J. M., Arcos-Burgos M., Scott A. F. A genome-wide association study of cleft lip with and without cleft palate identifies risk variants near MAFB and ABCA4. (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2010. — Vol. 42, no. 6. — P. 525—529. — doi:10.1038/ng.580. — PMID 20436469. — PMC 2941216.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]