Герба́рий Моско́вского университе́та (также — Гербарий и́мени Сыре́йщикова) — старейший и второй по величине гербарий России. Возник, вероятно, около 1765 года. Является структурным подразделением кафедры геоботаники биологического факультета МГУ.
| Гербарий Московского университета (Гербарий МГУ) | |
|---|---|
 Зал Гербария Московского университета | |
| Международное название | MW |
| Основан | 1765 |
| Директор | вакантно |
| Сотрудников | 7 |
| Расположение |
 Россия: Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 12, аудитории 401 и 501 |
| Сайт | plant.depo.msu.ru |
| Награды | Вики-премия «Свободные знания» (2018) |
 Медиафайлы на Викискладе | |
Объём основных фондов — 1 030 669 образцов (на ноябрь 2017 года)[1], прирост фондов в 2016 году — 22 013 образцов. Имеет международный акроним MW. В основных фондах гербария хранятся образцы, принадлежащие 37 100 видам сосудистых растений и 2223 видам мохообразных[2].
Находится на 62-м месте по объёму фондов среди всех гербариев мира, на 24-м месте среди гербариев вузов.
В гербарии сосредоточены важнейшие коллекции по флоре средней полосы России, важные коллекции по флоре других регионов России, Кавказа, Средней Азии, Казахстана, Монголии, а также по мохообразным России; важные именные коллекции (Георга Гофмана, Фридриха Эрхарта, Карла Триниуса, отца и сына Форстеров, а также коллекции, имеющие отношение к Карлу Линнею).
В конце 2015 года в гербарии работало шестеро сотрудников и до 15 внештатных помощников. В начале XXI века гербарий посещали более 50 посетителей в год[3].
В 2015 — 2017 гг. в рамках проекта Московского университета по созданию национального банка-депозитария живых систем осуществлена полная оцифровка (сканирование, создание базы данных) фондов Гербария. На конец 2017 года отсканированы и опубликованы в интернете сканы 911 тыс. образцов[4].
История
правитьКоллекции
правитьКоллекторы
правитьМногие ботаники и естествоиспытатели передавали свои коллекции в Гербарий МГУ. Это прежде всего сотрудники и профессора Московского университета, его выпускники, а также видные учёные, пересылавшие дублеты своих сборов из других учреждений. Важнейшие коллекторы Гербария Московского университета, о которых имеются статьи в Википедии, перечислены ниже в алфавитном порядке:
- Алексеев, Евгений Борисович [1]
- Алёхин, Василий Васильевич [2]
- Анненков, Николай Иванович [3]
- Арнольди, Владимир Митрофанович [4]
- Артари, Александр Петрович [5]
- Баньковский, Лев Владимирович [6] (дублеты)
- Берг, Лев Семёнович [7]
- Варсанофьева, Вера Александровна [8]
- Воронов, Анатолий Георгиевич [9]
- Гептнер, Владимир Георгиевич [10]
- Говорухин, Василий Сергеевич [11]
- Голенкин, Михаил Ильич [12]
- Горожанкин, Иван Николаевич [13]
- Гроссет, Гуго Эдгарович [14]
- Губанов, Иван Алексеевич [15]
- Доктуровский, Владимир Семёнович [16]
- Еленевский, Андрей Георгиевич [17] (сборы с Кубы)
- Ена, Андрей Васильевич [18] (дублеты)
- Житков, Борис Михайлович [19]
- Зернов, Александр Сергеевич [20]
- Иконников, Сергей Сергеевич [21] (дублеты)
- Ильин, Модест Михайлович [22] (дублеты)
- Казанский, Николай Александрович [23]
- Камелин, Рудольф Владимирович [24] (дублеты)
- Каминг, Хью [25] (дублеты)
- Караваев, Михаил Николаевич [26]
- Кауфман, Николай Николаевич [27]
- Комаров, Владимир Леонтьевич [28] (дублеты)
- Красноборов, Иван Моисеевич [29] (дублеты)
- Кречетович, Лев Мельхиседекович [30]
- Куваев, Владимир Борисович [31]
- Кудряшов, Леонид Васильевич [32]
- Липшиц, Сергей Юльевич [33]
- Литвинов, Дмитрий Иванович [34]
- Мазуренко, Мая Тимофеевна [35] (дублеты)
- Максимович, Михаил Александрович [36]
- Малышев, Леонид Иванович [37] (ранние сборы)
- Муралевич, Вячеслав Степанович [38]
- Мяздриков, Иван Петрович [39]
- Назаров, Михаил Иванович [40]
- Нейштадт, Марк Ильич [41]
- Новиков, Владимир Сергеевич [42]
- Новопокровский, Иван Васильевич [43]
- Носков, Александр Куприянович [44]
- Павлов, Вадим Николаевич [45]
- Павлов, Николай Васильевич [46]
- Петунников, Алексей Николаевич [47]
- Пименов, Михаил Георгиевич [48]
- Портениер, Николай Николаевич [49] (дублеты)
- Работнов, Тихон Александрович [50]
- Серебряков, Иван Григорьевич [51] (ранние сборы)
- Серёгин, Алексей Петрович [52]
- Скворцов, Алексей Константинович [53] (ранние сборы)
- Смирнов, Павел Александрович (биолог) [54]
- Соколов, Дмитрий Дмитриевич [55]
- Станков, Сергей Сергеевич [56]
- Старобогатов, Ярослав Игоревич [57]
- Сукачёв, Владимир Николаевич [58]
- Сырейщиков, Дмитрий Петрович [59]
- Сюзев, Павел Васильевич [60] (дублеты)
- Тихомиров, Вадим Николаевич [61]
- Трофимов, Тит Трофимович [62]
- Турчанинов, Николай Степанович [63] (дублеты)
- Тыртиков, Алексей Павлович [64]
- Тюремнов, Сергей Николаевич [65]
- Уранов, Алексей Александрович [66] (ранние сборы)
- Флёров, Александр Фёдорович [67]
- Формозов, Александр Николаевич [68]
- Харкевич, Сигизмунд Семёнович [69] (дублеты)
- Хохряков, Андрей Павлович [70] (дублеты)
- Цвелёв, Николай Николаевич [71] (дублеты)
- Цейгер, Карл Людвиг Филипп [72] (дублеты)
- Цингер, Василий Яковлевич [73]
- Чистяков, Иван Дорофеевич [74]
- Шретер, Алексей Иванович [75]
- Щукин, Иван Семёнович [76]
- Эклон, Христиан Фредерик [77] (дублеты)
- Юнатов, Александр Афанасьевич [78]
- Юрцев, Борис Александрович [79] (ранние сборы)
- Ярошенко, Павел Дионисьевич [80] (дублеты)
Научная деятельность
правитьИсходя из размеров и научной деятельности того или иного гербария, за ними закрепляется право определенного количества голосов на Номенклатурной секции Международного ботанического конгресса. Цель заседаний Номенклатурной секции — внесение текущих изменений в Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений. На Конгрессе в Шэньчжэне (июль 2017 г.) за российскими Гербариями закреплено 24 голоса из 926, в т.ч. три голоса за Гербарием МГУ [5]. Это на один голос больше, чем в 2011 году.
Оцифровка коллекций
правитьРанее, в конце 1990-х — начале 2000-х гг. при поддержке РФФИ (грант № 98-07-91048э) было отсканировано и размещено в Интернете (http://herba.msu.ru/pictures/mw_type/index.html) около 600 изображений типов гербария МГУ. Кроме того, 63 образца были изданы на CD «Herbarium Linnaeanum». С тех пор работы по оцифровке не получали специального финансирования и были приостановлены.
В рамках комплексной программы «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем» (грант РНФ № 14-50-00029) по направлению «Растения» Гербарий МГУ получил финансирование на оцифровку коллекций. Коллектив гербария задался целью за три года перевести в цифровой вид и представить в Интернете около 1 млн образцов из фондов гербария МГУ. Согласно приоритетам РНФ (Арктика, Дальний Восток), в качестве пилотных объектов по оцифровке фондов в 2015 г. были выбраны отделы Сибири — Дальнего Востока и Восточной Европы. В 2005 г. сотрудниками были подведены итоги инвентаризации фондов Гербария, занявшей более 10 лет. В последующие годы табличная база данных ежегодно актуализировалась, в ней учитывались новые включения и переопределения. Перед началом работ по оцифровке была выполнена работа по верификации содержательной части базы по сосудистым растениям[6].
Каждый из образцов до сканирования проходил через несколько процедур, необходимых для получения информативных изображений. На каждый лист был наклеен штрихкод международного стандарта с уникальным идентификатором образца. Далее у каждого образца открывалась этикетка (если она была закрыта растением или сложена), важные отломанные фрагменты растений прикреплялись к образцу, проверялось наличие ярлыков с переопределениями и порядок расположения фондового материала. В редких случаях приходилось заменять ветхие обложки, исправлять указатели, размещать образцы мелкого формата на стандартных листах монтировочной бумаги, повторно проверять номенклатуру. Всего в этой работе (вместе с помощниками) принимало участие 65 человек.
Сканирование коллекции велось силами компании-партнера. Этот процесс осуществлялся согласно техническому заданию со следующими основными параметрами изображений. Основное изображение: формат TIFF, 300 dpi; размер файла до 60 MB; массив свыше 30TB. Копия: формат JPG, 300 dpi; сжатие 80 %; размер файла до 2,5 MB; массив около 1,5 TB. Этапы машинной обработки включали: разворот на 90 градусов, обрезку чёрного поля, доворот до прямого угла, распознавание штрихкода, создание JPG-копии[7].
Научной группой осуществлялась выдача материала на сканирование, обратное вкладывание образцов в обложки, проверка комплектности, возврат в места постоянного хранения. Кроме того, при необходимости выполнялась внеплановая работа: проверка качества изображений после калибровки сканеров; поиск и выдача образцов, отсканированных с физическим браком; поиск образцов с пропущенными штрихкодами; поиск пропущенных образцов; проверка списков папок, отсутствовавших в БД; проверка дублированных файлов.
Созданная в 2015 г. коллекция изображений отсканированных гербарных образцов из фондов гербария МГУ насчитывала сканы 502 тыс. образцов, из которых 156 тыс. из отдела Сибири — Дальнего Востока и 346 тыс. из отдела Восточной Европы[8].
В 2016 году отсканированы отделы Кавказа, Крыма, Монголии, Зарубежной Азии, Herbarium Alchemillarum и типовые образцы (около 215 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария мхов (73 тыс. образцов)[9].
В 2017 году отсканированы отделы Средней Азии и Казахстана (96 000 образцов), Америки (12 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария печеночников (4 тыс. образцов) и новые включения[10].
В 2018 году отсканированы отделы Западной Европы (40 000 образцов), Австралии и Океании (3 300 образцов), а также новые включения. В начале ноября 2018 года работы по оцифровке коллекции полностью завершены[11].
Цифровой гербарий МГУ
править
В результате оцифровки фондов в 2015—2017 гг. объём Цифрового гербария МГУ на 1 января 2018 года составил 911 тысяч образцов[12]. По результатам трёх лет проекта Гербарий МГУ занимает восьмое место в мире по объёмам оцифрованных и опубликованных в интернете фондов (уступает гербариям P, L, NY, PE, US, BR, MEXU)[13]. Он обладает крупнейшими оцифрованными коллекциями по флоре России, Украины, Белоруссии, Молдавии, Казахстана, Латвии, государств Закавказья (кроме Армении), Монголии, Казахстана и четырёх республик Средней Азии[14]. Кроме того, это вторая по величине точка доступа к оцифрованным гербарным образцам из Армении, Литвы, КНДР, Мали и третья для Кипра и Вьетнама.
Публикация отсканированных образцов ведется через двуязычный портал Национального банка-депозитария живых систем (доступны как публичная[15], так и операционная[4] версии). На 1 января 2018 года на портале содержались отсканированные изображения 910 820 гербарных образцов, принадлежащих к 35 615 видам сосудистых растений и мхов[4].
Идет работа по наполнению Цифрового гербария МГУ полными метаданными отсканированных образцов, которые включают текст оригинальных этикеток и географические координаты мест сбора каждого образца. Эта работа осуществляется с привлечением волонтёров[16]. На 7 ноября 2018 года географические привязки доступны для 288 751 образцов, для 122 906 образцов в базу данных внесён полный текст этикеток, а ещё для 339 396 образцов отдельные элементы этикеток распознаны автоматически с помощью OCR[4]. С октября 2017 года геопривязка образцов осуществляется с использованием разработанной системы «ИСТРА» (Интеллектуальная Система Топонимического Распознавания и Атрибутирования), которая автоматически привязывает образцы растений к географической точке[17].
Цифровой гербарий МГУ — крупнейший донор информации о биоразнообразии России для Global Biodiversity Information Facility, международной платформы-агрегатора пространственных биологических данных. Информация о гербарных образцах из Московского университета составляет 65 % от общего объёма электронных данных, опубликованных на GBIF российскими учреждениями, и 23 % от всех имеющихся на GBIF данных о биоразнообразии России[18][19].
Атлас флоры России
правитьНа платформе iNaturalist сотрудниками Гербария МГУ организован сбор данных по флоре России на основе принципов «гражданской науки»[20]. Это проект «Флора России». Любой пользователь может загрузить фотографию растения и отметить точку съёмки на карте. После проверки определения данные получают «исследовательский уровень» и также экспортируются в GBIF. Проект был запущен в середине января 2019 года как соревнование между региональными командами[21]. За первый месяц он привлёк более тысячи участников, а число загруженных наблюдений превысило 30 тысяч[22].
В конце октября 2019 года на «Флоре России» было уже более 200 тысяч изображений, выложенных 3670 участниками[23].
Примерно пятая часть изображений на «Флоре России» остается под несвободной лицензией. По состоянию на декабрь 2019 года под свободной лицензией были 225 885 изображений от 3832 человек, а под несвободными лицензиями оставались 45 722 изображений (20,2 % от общего числа загруженных) от 2258 пользователей[24].
В платформу встроено автоматическое распознавание растений на основе нейросети. Каждая загруженная фотография после проверки определения экспертами используется для обучения системы, что вкупе с пространственными данными о распространении растений позволяет совершенствовать алгоритмы машинного определения[25].
Информация для посетителей
правитьГербарий Московского университета открыт для профессиональных ботаников, ведущих научные исследования, с понедельника по пятницу с 9 до 17 часов без предварительного уведомления. Гербарий расположен в биолого-почвенном корпусе МГУ в аудиториях 401 и 501. Сотрудники Гербария, по предварительному согласованию, устраивают ознакомительные экскурсии для непрофессиональных посетителей[1].
Заведующий Гербарием в 2017 году — член-корреспондент РАН, заслуженный профессор МГУ, доктор биологических наук Вадим Николаевич Павлов[1].
Гербарий постоянно привлекает к работе волонтёров, имеющих начальные познания в ботанике[26][27].
С лета 2017 года в Гербарии МГУ открыта конкурсная программа трёх-шестимесячных стажировок для аспирантов российских организаций. Осенью 2017 года открыта программа бесплатных стажировок по программе менторства для студентов естественных факультетов московских вузов[28].
См. также
правитьСсылки
правитьПримечания
править- ↑ 1 2 3 Herbarium Details: Moscow State University (англ.). Index Herbariorum. International Plant Science Center; The New York Botanical Garden (декабрь 2010). Дата обращения: 15 октября 2014. Архивировано 23 марта 2012 года.
- ↑ Ох ты, ну не хрена ж себе | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
- ↑ Коллекции. depo.msu.ru. Дата обращения: 8 февраля 2018. Архивировано 8 февраля 2018 года.
- ↑ 1 2 3 4 Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 1 мая 2023 года.
- ↑ Архивированная копия. Дата обращения: 15 марта 2020. Архивировано из оригинала 2 февраля 2017 года.
- ↑ А. П. Серёгин, Т. П. Баландина, Н. С. Гамова, К. В. Дудова, Н. К. Шведчикова. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — С. 94–97. Архивировано 2 мая 2023 года.
- ↑ Alexey Seregin, T.P. Balandina, N.S. Gamova, K.V. Dudova, N.K.Shvedchikova. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — doi:10.13140/RG.2.1.2119.0004.
- ↑ Alexey P. Seregin. Making the Russian Flora Visible: Fast Digitisation of the Moscow University Herbarium (MW) in 2015 (англ.) // Taxon. — 2016-03-08. — Vol. 65, iss. 1. — P. 205–207. — doi:10.12705/651.29.
- ↑ Новости проекта | depozitariy. depository.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 9 декабря 2022 года.
- ↑ Alexey P Seregin. Moscow Digital Herbarium and the National Depository Bank of Live Systems Initiative (Russia). — 2017. — doi:10.13140/RG.2.2.14641.68961.
- ↑ В цифровой коллекции Гербарии МГУ — более миллиона образцов. www.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 19 мая 2022 года.
- ↑ Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
- ↑ Alexey P. Seregin. THE LARGEST DIGITAL HERBARIUM IN RUSSIA IS NOW AVAILABLE ONLINE! (англ.) // TAXON. — 2018-04. — Vol. 67, iss. 2. — P. 465–467. — ISSN 1996-8175 0040-0262, 1996-8175. — doi:10.12705/672.34. Архивировано 1 марта 2023 года.
- ↑ Alexey Seregin. Moscow University Herbarium (MW) (англ.) // Lomonosov Moscow State University. — 2023. — doi:10.15468/cpnhcc. Архивировано 29 декабря 2017 года.
- ↑ Все направления. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
- ↑ Alexey Seregin. Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. ВКонтакте (27 июня 2017). Дата обращения: 1 марта 2023.
- ↑ В Цифровом гербарии МГУ заработала система автоматической геопривязки ИСТРА. www.msu.ru. МГУ (30 октября 2017). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 25 марта 2022 года.
- ↑ Russian Federation (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
- ↑ А П Серегин. «Атлас флоры России» на платформе Цифрового гербария МГУ. — 2018. — doi:10.13140/RG.2.2.19798.50241.
- ↑ Флора России и Крыма | Flora of Russia and the Crimea. iNaturalist. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
- ↑ Фотоохота на растения России объявляется открытой. Цифровой гербарий МГУ Вконтакте. ВКонтакте (12 января 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
- ↑ Alexey P. Seregin. Большой рубеж: 30 000 наблюдений !!! iNaturalist (23 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 24 февраля 2019 года.
- ↑ Наука и жизнь. — 2019. — № 12. — С. 22.
- ↑ Alexey P. Seregin. Россия vs. Мексика на iNaturalist.org: остался последний рывок! iNaturalist (1 января 2020). Дата обращения: 1 марта 2023.
- ↑ Может ли машинный интеллект опознавать растения? Цифровой гербарий МГУ ВКонтакте. ВКонтакте (1 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
- ↑ Субботник для волонтеров в Гербарии МГУ: добро.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
- ↑ Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
- ↑ Алло, мы ищем таланты! В рамках.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.