Википедия

Гербарий Московского университета

Герба́рий Моско́вского университе́та (также — Гербарий и́мени Сыре́йщикова) — старейший и второй по величине гербарий России. Возник, вероятно, около 1765 года. Является структурным подразделением кафедры геоботаники биологического факультета МГУ.

Гербарий Московского университета
(Гербарий МГУ)
Зал Гербария Московского университета
Зал Гербария Московского университета
Международное название MW
Основан 1765
Директор вакантно
Сотрудников 7
Расположение  Россия: Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 12, аудитории 401 и 501
Сайт plant.depo.msu.ru
Награды Вики-премия «Свободные знания» (2018)
Логотип Викисклада Медиафайлы на Викискладе

Объём основных фондов — 1 030 669 образцов (на ноябрь 2017 года)[1], прирост фондов в 2016 году — 22 013 образцов. Имеет международный акроним MW. В основных фондах гербария хранятся образцы, принадлежащие 37 100 видам сосудистых растений и 2223 видам мохообразных[2].

Находится на 62-м месте по объёму фондов среди всех гербариев мира, на 24-м месте среди гербариев вузов.

В гербарии сосредоточены важнейшие коллекции по флоре средней полосы России, важные коллекции по флоре других регионов России, Кавказа, Средней Азии, Казахстана, Монголии, а также по мохообразным России; важные именные коллекции (Георга Гофмана, Фридриха Эрхарта, Карла Триниуса, отца и сына Форстеров, а также коллекции, имеющие отношение к Карлу Линнею).

В конце 2015 года в гербарии работало шестеро сотрудников и до 15 внештатных помощников. В начале XXI века гербарий посещали более 50 посетителей в год[3].

В 2015 — 2017 гг. в рамках проекта Московского университета по созданию национального банка-депозитария живых систем осуществлена полная оцифровка (сканирование, создание базы данных) фондов Гербария. На конец 2017 года отсканированы и опубликованы в интернете сканы 911 тыс. образцов[4].

История

править
Основная статья: История Гербария Московского университета

Коллекции

править
Основная статья: Коллекции Гербария Московского университета
Основная статья: Отдел Восточной Европы в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Крыма в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Кавказа в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Сибири и Дальнего Востока в Гербарии Московского университета
Основная статья: Отдел Средней Азии и Казахстана в Гербарии Московского университета
Основная статья: Зарубежные отделы в Гербарии Московского университета
Основная статья: Гербарий мохообразных в Гербарии Московского университета
Основная статья: Herbarium Alchemillarum в Гербарии Московского университета
Основная статья: Немонтированные коллекции в Гербарии Московского университета

Коллекторы

править

Многие ботаники и естествоиспытатели передавали свои коллекции в Гербарий МГУ. Это прежде всего сотрудники и профессора Московского университета, его выпускники, а также видные учёные, пересылавшие дублеты своих сборов из других учреждений. Важнейшие коллекторы Гербария Московского университета, о которых имеются статьи в Википедии, перечислены ниже в алфавитном порядке:

Научная деятельность

править
Основная статья: Научная деятельность Гербария Московского университета

Исходя из размеров и научной деятельности того или иного гербария, за ними закрепляется право определенного количества голосов на Номенклатурной секции Международного ботанического конгресса. Цель заседаний Номенклатурной секции — внесение текущих изменений в Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений. На Конгрессе в Шэньчжэне (июль 2017 г.) за российскими Гербариями закреплено 24 голоса из 926, в т.ч. три голоса за Гербарием МГУ [5]. Это на один голос больше, чем в 2011 году.

Оцифровка коллекций

править

Ранее, в конце 1990-х — начале 2000-х гг. при поддержке РФФИ (грант № 98-07-91048э) было отсканировано и размещено в Интернете (http://herba.msu.ru/pictures/mw_type/index.html) около 600 изображений типов гербария МГУ. Кроме того, 63 образца были изданы на CD «Herbarium Linnaeanum». С тех пор работы по оцифровке не получали специального финансирования и были приостановлены.

В рамках комплексной программы «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем» (грант РНФ № 14-50-00029) по направлению «Растения» Гербарий МГУ получил финансирование на оцифровку коллекций. Коллектив гербария задался целью за три года перевести в цифровой вид и представить в Интернете около 1 млн образцов из фондов гербария МГУ. Согласно приоритетам РНФ (Арктика, Дальний Восток), в качестве пилотных объектов по оцифровке фондов в 2015 г. были выбраны отделы Сибири — Дальнего Востока и Восточной Европы. В 2005 г. сотрудниками были подведены итоги инвентаризации фондов Гербария, занявшей более 10 лет. В последующие годы табличная база данных ежегодно актуализировалась, в ней учитывались новые включения и переопределения. Перед началом работ по оцифровке была выполнена работа по верификации содержательной части базы по сосудистым растениям[6].

Каждый из образцов до сканирования проходил через несколько процедур, необходимых для получения информативных изображений. На каждый лист был наклеен штрихкод международного стандарта с уникальным идентификатором образца. Далее у каждого образца открывалась этикетка (если она была закрыта растением или сложена), важные отломанные фрагменты растений прикреплялись к образцу, проверялось наличие ярлыков с переопределениями и порядок расположения фондового материала. В редких случаях приходилось заменять ветхие обложки, исправлять указатели, размещать образцы мелкого формата на стандартных листах монтировочной бумаги, повторно проверять номенклатуру. Всего в этой работе (вместе с помощниками) принимало участие 65 человек.

Сканирование коллекции велось силами компании-партнера. Этот процесс осуществлялся согласно техническому заданию со следующими основными параметрами изображений. Основное изображение: формат TIFF, 300 dpi; размер файла до 60 MB; массив свыше 30TB. Копия: формат JPG, 300 dpi; сжатие 80 %; размер файла до 2,5 MB; массив около 1,5 TB. Этапы машинной обработки включали: разворот на 90 градусов, обрезку чёрного поля, доворот до прямого угла, распознавание штрихкода, создание JPG-копии[7].

Научной группой осуществлялась выдача материала на сканирование, обратное вкладывание образцов в обложки, проверка комплектности, возврат в места постоянного хранения. Кроме того, при необходимости выполнялась внеплановая работа: проверка качества изображений после калибровки сканеров; поиск и выдача образцов, отсканированных с физическим браком; поиск образцов с пропущенными штрихкодами; поиск пропущенных образцов; проверка списков папок, отсутствовавших в БД; проверка дублированных файлов.

Созданная в 2015 г. коллекция изображений отсканированных гербарных образцов из фондов гербария МГУ насчитывала сканы 502 тыс. образцов, из которых 156 тыс. из отдела Сибири — Дальнего Востока и 346 тыс. из отдела Восточной Европы[8].

В 2016 году отсканированы отделы Кавказа, Крыма, Монголии, Зарубежной Азии, Herbarium Alchemillarum и типовые образцы (около 215 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария мхов (73 тыс. образцов)[9].

В 2017 году отсканированы отделы Средней Азии и Казахстана (96 000 образцов), Америки (12 000 образцов), а также этикетки с конвертов гербария печеночников (4 тыс. образцов) и новые включения[10].

В 2018 году отсканированы отделы Западной Европы (40 000 образцов), Австралии и Океании (3 300 образцов), а также новые включения. В начале ноября 2018 года работы по оцифровке коллекции полностью завершены[11].

Цифровой гербарий МГУ

править
 
Станислав Козловский вручает Алексею Серёгину премию «Свободные знания» за проект «Цифровой гербарий МГУ»

В результате оцифровки фондов в 2015—2017 гг. объём Цифрового гербария МГУ на 1 января 2018 года составил 911 тысяч образцов[12]. По результатам трёх лет проекта Гербарий МГУ занимает восьмое место в мире по объёмам оцифрованных и опубликованных в интернете фондов (уступает гербариям P, L, NY, PE, US, BR, MEXU)[13]. Он обладает крупнейшими оцифрованными коллекциями по флоре России, Украины, Белоруссии, Молдавии, Казахстана, Латвии, государств Закавказья (кроме Армении), Монголии, Казахстана и четырёх республик Средней Азии[14]. Кроме того, это вторая по величине точка доступа к оцифрованным гербарным образцам из Армении, Литвы, КНДР, Мали и третья для Кипра и Вьетнама.

Публикация отсканированных образцов ведется через двуязычный портал Национального банка-депозитария живых систем (доступны как публичная[15], так и операционная[4] версии). На 1 января 2018 года на портале содержались отсканированные изображения 910 820 гербарных образцов, принадлежащих к 35 615 видам сосудистых растений и мхов[4].

Идет работа по наполнению Цифрового гербария МГУ полными метаданными отсканированных образцов, которые включают текст оригинальных этикеток и географические координаты мест сбора каждого образца. Эта работа осуществляется с привлечением волонтёров[16]. На 7 ноября 2018 года географические привязки доступны для 288 751 образцов, для 122 906 образцов в базу данных внесён полный текст этикеток, а ещё для 339 396 образцов отдельные элементы этикеток распознаны автоматически с помощью OCR[4]. С октября 2017 года геопривязка образцов осуществляется с использованием разработанной системы «ИСТРА» (Интеллектуальная Система Топонимического Распознавания и Атрибутирования), которая автоматически привязывает образцы растений к географической точке[17].

Цифровой гербарий МГУ — крупнейший донор информации о биоразнообразии России для Global Biodiversity Information Facility, международной платформы-агрегатора пространственных биологических данных. Информация о гербарных образцах из Московского университета составляет 65 % от общего объёма электронных данных, опубликованных на GBIF российскими учреждениями, и 23 % от всех имеющихся на GBIF данных о биоразнообразии России[18][19].

Атлас флоры России

править
Основная статья: Флора России (интернет-проект)

На платформе iNaturalist сотрудниками Гербария МГУ организован сбор данных по флоре России на основе принципов «гражданской науки»[20]. Это проект «Флора России». Любой пользователь может загрузить фотографию растения и отметить точку съёмки на карте. После проверки определения данные получают «исследовательский уровень» и также экспортируются в GBIF. Проект был запущен в середине января 2019 года как соревнование между региональными командами[21]. За первый месяц он привлёк более тысячи участников, а число загруженных наблюдений превысило 30 тысяч[22].

В конце октября 2019 года на «Флоре России» было уже более 200 тысяч изображений, выложенных 3670 участниками[23].

Примерно пятая часть изображений на «Флоре России» остается под несвободной лицензией. По состоянию на декабрь 2019 года под свободной лицензией были 225 885 изображений от 3832 человек, а под несвободными лицензиями оставались 45 722 изображений (20,2 % от общего числа загруженных) от 2258 пользователей[24].

В платформу встроено автоматическое распознавание растений на основе нейросети. Каждая загруженная фотография после проверки определения экспертами используется для обучения системы, что вкупе с пространственными данными о распространении растений позволяет совершенствовать алгоритмы машинного определения[25].

Информация для посетителей

править

Гербарий Московского университета открыт для профессиональных ботаников, ведущих научные исследования, с понедельника по пятницу с 9 до 17 часов без предварительного уведомления. Гербарий расположен в биолого-почвенном корпусе МГУ в аудиториях 401 и 501. Сотрудники Гербария, по предварительному согласованию, устраивают ознакомительные экскурсии для непрофессиональных посетителей[1].

Заведующий Гербарием в 2017 году — член-корреспондент РАН, заслуженный профессор МГУ, доктор биологических наук Вадим Николаевич Павлов[1].

Гербарий постоянно привлекает к работе волонтёров, имеющих начальные познания в ботанике[26][27].

С лета 2017 года в Гербарии МГУ открыта конкурсная программа трёх-шестимесячных стажировок для аспирантов российских организаций. Осенью 2017 года открыта программа бесплатных стажировок по программе менторства для студентов естественных факультетов московских вузов[28].

См. также

править

Ссылки

править

Примечания

править
  1. ↑ 1 2 3 Herbarium Details: Moscow State University (англ.). Index Herbariorum. International Plant Science Center; The New York Botanical Garden (декабрь 2010). Дата обращения: 15 октября 2014. Архивировано 23 марта 2012 года.
  2. ↑ Ох ты, ну не хрена ж себе | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  3. ↑ Коллекции. depo.msu.ru. Дата обращения: 8 февраля 2018. Архивировано 8 февраля 2018 года.
  4. ↑ 1 2 3 4 Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 1 мая 2023 года.
  5. ↑ Архивированная копия. Дата обращения: 15 марта 2020. Архивировано из оригинала 2 февраля 2017 года.
  6. ↑ А. П. Серёгин, Т. П. Баландина, Н. С. Гамова, К. В. Дудова, Н. К. Шведчикова. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — С. 94–97. Архивировано 2 мая 2023 года.
  7. ↑ Alexey Seregin, T.P. Balandina, N.S. Gamova, K.V. Dudova, N.K.Shvedchikova. Гербарий Московского университета (MW) в 2015 году: первый год новой эры. — 2016. — doi:10.13140/RG.2.1.2119.0004.
  8. ↑ Alexey P. Seregin. Making the Russian Flora Visible: Fast Digitisation of the Moscow University Herbarium (MW) in 2015 (англ.) // Taxon. — 2016-03-08. — Vol. 65, iss. 1. — P. 205–207. — doi:10.12705/651.29.
  9. ↑ Новости проекта | depozitariy. depository.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 9 декабря 2022 года.
  10. ↑ Alexey P Seregin. Moscow Digital Herbarium and the National Depository Bank of Live Systems Initiative (Russia). — 2017. — doi:10.13140/RG.2.2.14641.68961.
  11. ↑ В цифровой коллекции Гербарии МГУ — более миллиона образцов. www.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 19 мая 2022 года.
  12. ↑ Депозитарий живых систем. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
  13. ↑ Alexey P. Seregin. THE LARGEST DIGITAL HERBARIUM IN RUSSIA IS NOW AVAILABLE ONLINE! (англ.) // TAXON. — 2018-04. — Vol. 67, iss. 2. — P. 465–467. — ISSN 1996-8175 0040-0262, 1996-8175. — doi:10.12705/672.34. Архивировано 1 марта 2023 года.
  14. ↑ Alexey Seregin. Moscow University Herbarium (MW) (англ.) // Lomonosov Moscow State University. — 2023. — doi:10.15468/cpnhcc. Архивировано 29 декабря 2017 года.
  15. ↑ Все направления. plant.depo.msu.ru. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
  16. ↑ Alexey Seregin. Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. ВКонтакте (27 июня 2017). Дата обращения: 1 марта 2023.
  17. ↑ В Цифровом гербарии МГУ заработала система автоматической геопривязки ИСТРА. www.msu.ru. МГУ (30 октября 2017). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 25 марта 2022 года.
  18. ↑ Russian Federation (англ.). www.gbif.org. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 13 января 2023 года.
  19. ↑ А П Серегин. «Атлас флоры России» на платформе Цифрового гербария МГУ. — 2018. — doi:10.13140/RG.2.2.19798.50241.
  20. ↑ Флора России и Крыма | Flora of Russia and the Crimea. iNaturalist. Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 1 марта 2023 года.
  21. ↑ Фотоохота на растения России объявляется открытой. Цифровой гербарий МГУ Вконтакте. ВКонтакте (12 января 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
  22. ↑ Alexey P. Seregin. Большой рубеж: 30 000 наблюдений !!! iNaturalist (23 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023. Архивировано 24 февраля 2019 года.
  23. ↑ Наука и жизнь. — 2019. — № 12. — С. 22.
  24. ↑ Alexey P. Seregin. Россия vs. Мексика на iNaturalist.org: остался последний рывок! iNaturalist (1 января 2020). Дата обращения: 1 марта 2023.
  25. ↑ Может ли машинный интеллект опознавать растения? Цифровой гербарий МГУ ВКонтакте. ВКонтакте (1 февраля 2019). Дата обращения: 1 марта 2023.
  26. ↑ Субботник для волонтеров в Гербарии МГУ: добро.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  27. ↑ Мы сделали первый шаг по очень длинному пути.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
  28. ↑ Алло, мы ищем таланты! В рамках.. | Цифровой гербарий МГУ - Moscow Digital Herbarium | ВКонтакте. m.vk.com. Дата обращения: 2 мая 2023. Архивировано 2 мая 2023 года.
Источник — https://ru.wiki.x.io/w/index.php?title=Гербарий_Московского_университета&oldid=134099519