Синдекан 3

Синдекан 3 (англ. syndecan 3) — мембранный белок, протеогликан семейства синдеканов, или трансмембранных гепарансульфатпротеогликанов. Продукт гена человека SDC3. Несёт на поверхности гепарансульфатные цепи.

Синдекан 3
Идентификаторы
Символ	SDC3 ; SDCN; SYND3
Внешние ID	OMIM: 186357 MGI: 1349163 HomoloGene: 7965 GeneCards: Ген SDC3
Генная онтология Функция • cytoskeletal protein binding Компонент клетки • Golgi lumen • plasma membrane • membrane • integral component of membrane • lysosomal lumen Биологический процесс • retinoid metabolic process • carbohydrate metabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • glycosaminoglycan catabolic process • phototransduction, visible light • extracellular matrix organization • glycosaminoglycan metabolic process • chondroitin sulfate metabolic process • small molecule metabolic process Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	9672	20970
Ensembl	ENSG00000162512	ENSMUSG00000025743
UniProt	O75056	Q64519
RefSeq (мРНК)	NM_014654	NM_011520
RefSeq (белок)	NP_055469	NP_035650
Локус (UCSC)	Chr 1: 31.34 – 31.38 Mb	Chr 4: 130.79 – 130.83 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Функции

Белок является трансмембранным гепарансульфатпротеогликаном, входит в семейство синдеканов. Синдеканы опосредуют связывание клеток, передачу сигнала в клетке и организацию цитоскелета. Являются рецепторами для Tat-белка вируса ВИЧ. Синдекан 3 может содержать гепарансульфатные цепи. Играет роль в организации формы клетки, действуя на актиновый цитоскелет. Возможно, участвует в передаче сигнала с клеточной поверхности, опосредованного олигосахарами.

Структура

Зрелый белок состоит из 442 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 45,5 кДа. Включает N-концевой внеклеточный домен (387 аминокислот), единственный спиральный трансмембранный фрагмент и небольшой цитозольный участок с одним фосфорилируемым тирозином. На внеклеточном домене находится до 6 участков присоединения O-гепарансульфатных цепей.

Тканевая специфичность

Синдекан 3 экспрессирован в нервной системе, надпочечниках и селезёнке.

См. также

• Синдеканы
• Синдекан 1
• Синдекан 2

Литература

• Tyagi M., Rusnati M., Presta M., Giacca M. Internalization of HIV-1 tat requires cell surface heparan sulfate proteoglycans. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 5. — P. 3254—3261. — doi:10.1074/jbc.M006701200. — PMID 11024024.
• Koroll M., Rathjen F.G., Volkmer H. The neural cell recognition molecule neurofascin interacts with syntenin-1 but not with syntenin-2, both of which reveal self-associating activity. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 14. — P. 10646—10654. — doi:10.1074/jbc.M010647200. — PMID 11152476.
• Hakansson S., Jacobs A., Caffrey M. Heparin binding by the HIV-1 tat protein transduction domain. (англ.) // Protein Sci. : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 10. — P. 2138—2139. — doi:10.1110/ps.23401. — PMID 11567105. — PMC 2374215.
• Erdman R., Stahl R.C., Rothblum K., et al. Schwann cell adhesion to a novel heparan sulfate binding site in the N-terminal domain of alpha 4 type V collagen is mediated by syndecan-3. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 9. — P. 7619—7625. — doi:10.1074/jbc.M111311200. — PMID 11751872.
• Alvarez K., Fadic R., Brandan E. Augmented synthesis and differential localization of heparan sulfate proteoglycans in Duchenne muscular dystrophy. (англ.) // J. Cell. Biochem. : journal. — 2002. — Vol. 85, no. 4. — P. 703—713. — doi:10.1002/jcb.10184. — PMID 11968010.
• Pacifici M., Shimo T., Gentili C., et al. Syndecan-3: a cell-surface heparan sulfate proteoglycan important for chondrocyte proliferation and function during limb skeletogenesis (англ.) // J. Bone Miner. Metab. : journal. — 2005. — Vol. 23, no. 3. — P. 191—199. — doi:10.1007/s00774-004-0584-1. — PMID 15838620.
• Reizes O., Clegg D.J., Strader A.D., Benoit S.C. A role for syndecan-3 in the melanocortin regulation of energy balance (англ.) // Peptides : journal. — 2006. — February (vol. 27, no. 2). — P. 274—280. — doi:10.1016/j.peptides.2005.02.030. — PMID 16289473.

Ссылки

• Клеточный матрикс. Синдекан.