Ретротранспозоны

Ретротранспозоны (мобильные генетические элементы первого типа, или транспозоны, перемещающиеся через РНК-интермедиаты) — это генетические элементы, которые могут самовоспроизводиться в геноме и являются вездесущими компонентами ДНК многих эукариотических организмов.

Ретротранспозоны являются подклассом транспозонов. Ретротранспозоны широко распространены у растений, где они часто являются важным компонентом ядерной ДНК. У кукурузы 49-78 % генома состоит из ретротранспозонов,^[1] у пшеницы около 90 % генома представлены повторяющими последовательностями, из них 68 % — перемещающимися элементами.^[2] У млекопитающих практически половина генома (45-48 %) состоит из транспозонов или остатков транспозонов. Примерно 42 % генома человека состоит из ретротранспозонов, и около 2-3 % — из ДНК-транспозонов.^[3]

Классификация

Ретротранспозоны, или мобильные генетические элементы первого типа, состоят из двух подтипов — ретротранспозонов с длинными концевыми повторами (англ. LTR, long terminal repeats), и ретротранспозонов без длинных концевых повторов.

Последние в свою очередь делятся на длинные диспергированные повторы (англ. LINEs, long interspersed elements) и короткие диспергированные повторы (англ. SINE, short interspersed elements).

Примечания

↑ SanMiguel P., Bennetzen J. L. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (англ.) // Annals of Botany : journal. — 1998. — Vol. 82, no. Suppl A. — P. 37—44. — doi:10.1006/anbo.1998.0746. Архивировано 29 сентября 2009 года.
↑ Li W., Zhang P., Fellers J. P., Friebe B., Gill B. S. [www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome] (англ.) // Plant J.^[англ.] : journal. — 2004. — November (vol. 40, no. 4). — P. 500—511. — doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x. — PMID 15500466. (недоступная ссылка)
↑ Lander E. S., Linton L. M., Birren B., et al. Initial sequencing and analysis of the human genome (англ.) // Nature : journal. — 2001. — February (vol. 409, no. 6822). — P. 860—921. — doi:10.1038/35057062. — PMID 11237011. Архивировано 3 августа 2009 года.

Литература

Жимулев И. Ф. Общая и молекулярная генетика. — 1. — Новосибирск: Издательство Новосибирского университета, 2002. — 459 с. — 2000 экз. — ISBN 5761505096.
Liu, J., Gao, M., He, J., Wu, K., Lin, S., Jin, L., ... & Chen, J. (2021). The RNA m⁶A reader YTHDC1 silences retrotransposons and guards ES cell identity. Nature, 591(7849), 322-326. PMID 33658714 doi:10.1038/s41586-021-03313-9
Billon, V., & Cristofari, G. (2021). Nascent RNA m⁶A modification at the heart of the gene–retrotransposon conflict. Cell Research, 1-3. doi:10.1038/s41422-021-00518-5
Xu, Z., Ma, A. & Ma, Y.C. (2021). RNA methylation preserves ES cell identity by chromatin silencing of retrotransposons. Sig Transduct Target Ther 6, 258 . doi:10.1038/s41392-021-00683-4

См. также

[SanMiguelandBennetzen-1] SanMiguel P., Bennetzen J. L. Evidence that a recent increase in maize genome size was caused by the massive amplification of intergene retrotranposons (англ.) // Annals of Botany : journal. — 1998. — Vol. 82, no. Suppl A. — P. 37—44. — doi:10.1006/anbo.1998.0746. Архивировано 29 сентября 2009 года.

[LiandGill-2] Li W., Zhang P., Fellers J. P., Friebe B., Gill B. S. [www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x Sequence composition, organization, and evolution of the core Triticeae genome] (англ.) // Plant J.^[англ.] : journal. — 2004. — November (vol. 40, no. 4). — P. 500—511. — doi:10.1111/j.1365-313X.2004.02228.x. — PMID 15500466. (недоступная ссылка)

[Landeretal-3] Lander E. S., Linton L. M., Birren B., et al. Initial sequencing and analysis of the human genome (англ.) // Nature : journal. — 2001. — February (vol. 409, no. 6822). — P. 860—921. — doi:10.1038/35057062. — PMID 11237011. Архивировано 3 августа 2009 года.

[1]

[2]

[3]