Матриксная металлопротеиназа 9

Матриксная металлопротеиназа 9 (MMP9; «желатиназа B») - один из ферментов, участвующих в ремоделинге структур внеклеточного матрикса.

Матриксная металлопротеиназа 9
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1GKC, 1GKD, 1ITV, 1L6J, 2OVX, 2OVZ, 2OW0, 2OW1, 2OW2, 4H1Q, 4H2E, 4H3X, 4H82, 4HMA, 4JIJ, 4JQG, 4WZV, 4XCT, 5CUH, 5I12

Идентификаторы
ПсевдонимыMMP9, CLG4B, GELB, MANDP2, MMP-9, 92 kDa type IV collagenase, 92 kDa gelatinase, gelatinase B, matrix metallopeptidase 9
Внешние IDOMIM: 120361 MGI: 97011 HomoloGene: 3659 GeneCards: MMP9
Расположение гена (человек)
20-я хромосома человека
Хр.20-я хромосома человека[1]
20-я хромосома человека
Расположение в геноме MMP9
Расположение в геноме MMP9
Локус20q13.12Начало46,008,908 bp[1]
Конец46,016,561 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
2-я хромосома мыши
Хр.2-я хромосома мыши[2]
2-я хромосома мыши
Расположение в геноме MMP9
Расположение в геноме MMP9
Локус2 H3|2 85.27 cMНачало164,782,700 bp[2]
Конец164,797,770 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004994

NM_013599

RefSeq (белок)

NP_004985

NP_038627

Локус (UCSC)Chr 20: 46.01 – 46.02 MbChr 2: 164.78 – 164.8 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Клиническое значение

править

По данным одного исследования, один missense-полиморфизм гена MMP9 ассоциирован с риском развития межпозвоночной грыжи поясничного отдела[5].

См. также

править
  • MMP2, «желатиназа A»

Примечания

править
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100985 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017737 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Hirose Y., Chiba K., Karasugi T., Nakajima M., Kawaguchi Y., Mikami Y., Furuichi T., Mio F., Miyake A., Miyamoto T., Ozaki K., Takahashi A., Mizuta H., Kubo T., Kimura T., Tanaka T., Toyama Y., Ikegawa S. A functional polymorphism in THBS2 that affects alternative splicing and MMP binding is associated with lumbar-disc herniation (англ.) // Am. J. Hum. Genet.[англ.] : journal. — 2008. — May (vol. 82, no. 5). — P. 1122—1129. — doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.013. — PMID 18455130. — PMC 2427305.