Дезоксирибонуклеаза I

Дезоксирибонуклеаза I (ДНКаза I) — эндонуклеаза, закодированная геном DNASE1 в геноме человека. Синтезируется в основном в тканях пищеварительного тракта. Высокий уровень в моче, также присутствует в семенной жидкости и слюне.

Дезоксирибонуклеаза I
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 4AWN
Идентификаторы
Псевдонимы	DNASE1, DNL1, DRNI, deoxyribonuclease I, deoxyribonuclease 1
Внешние ID	OMIM: 125505 MGI: 103157 HomoloGene: 3826 GeneCards: DNASE1
Расположение гена (человек) Хр. 16-я хромосома человека Локус 16p13.3 Начало 3,611,728 bp Конец 3,680,143 bp
Расположение гена (Мышь) Хр. 16-я хромосома мыши Локус 16 A1|16 2.37 cM Начало 3,854,806 bp Конец 3,857,888 bp
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в tendon of biceps brachii body of pancreas buccal mucosa cell mucosa of ileum body of stomach right hemisphere of cerebellum Наибольшая экспрессия в vestibular membrane of cochlear duct stria vascularis proximal tubule vestibular sensory epithelium Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция nuclease activity endonuclease activity deoxyribonuclease I activity actin binding связывание с белками плазмы гидролазная активность deoxyribonuclease activity ДНК-связывающий Компонент клетки внеклеточная область экзосома ядерная оболочка клеточное ядро Биологический процесс DNA catabolic process nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis апоптоз DNA catabolic process, endonucleolytic neutrophil activation involved in immune response regulation of acute inflammatory response regulation of neutrophil mediated cytotoxicity Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 1773 13419 Ensembl ENSG00000213918 ENSMUSG00000005980 UniProt P24855 P49183 RefSeq (мРНК) NM_005223 NM_001351825 NM_001387135 NM_001387139 NM_001387140 NM_001387141 NM_010061 NM_001357143 RefSeq (белок) NP_005214 NP_001338754 NP_034191 NP_001344072 Локус (UCSC) Chr 16: 3.61 – 3.68 Mb Chr 16: 3.85 – 3.86 Mb Поиск по PubMed Искать Искать
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

ДНКаза I — нуклеаза, расщепляющая фосфодиэфирные связи в ДНК вблизи пиримидиновых нуклеотидов, образуя при этом полинуклеотиды с концевым-5'-фосфатом и свободной гидроксильной группой на 3'-конце. Обычно расщепление идет до тетрануклеотидов. Субстратами ДНКазы I являются: одноцепочечная ДНК, двуцепочечная ДНК, хроматин. ДНКаза I является эндонуклеазой, расщепляющей чужеродные и ненужные молекулы ДНК, также показана роль этого фермента во фрагментации ДНК при апоптозе.

Известно, что ДНКаза I связывает мономеры белка цитоскелета актина с высоким сродством (константа диссоциации ~ нМ) и полимеры актина с более низким сродством.

См. также

• Дезоксирибонуклеаза II

Литература

• Lachmann P.J. Lupus and desoxyribonuclease (неопр.) // Lupus. — 2003. — Т. 12, № 3. — С. 202—206. — doi:10.1191/0961203303lu357xx. — PMID 12708782.
• Yasuda T., Awazu S., Sato W., et al. Human genetically polymorphic deoxyribonuclease: purification, characterization, and multiplicity of urine deoxyribonuclease I (англ.) // J. Biochem. : journal. — 1991. — Vol. 108, no. 3. — P. 393—398. — PMID 2277032.
• Kishi K., Yasuda T., Ikehara Y., et al. Human serum deoxyribonuclease I (DNase I) polymorphism: pattern similarities among isozymes from serum, urine, kidney, liver, and pancreas (англ.) // Am. J. Hum. Genet. : journal. — 1990. — Vol. 47, no. 1. — P. 121—126. — PMID 2349940. — PMC 1683738.
• Kabsch W., Mannherz H.G., Suck D., et al. Atomic structure of the actin:DNase I complex (англ.) // Nature. — 1990. — Vol. 347, no. 6288. — P. 37—44. — doi:10.1038/347037a0. — PMID 2395459.
• Kishi K., Yasuda T., Awazu S., Mizuta K. Genetic polymorphism of human urine deoxyribonuclease I (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1989. — Vol. 81, no. 3. — P. 295—297. — doi:10.1007/BF00279009. — PMID 2921043.
• Rosenstreich D.L., Tu J.H., Kinkade P.R., et al. A human urine-derived interleukin 1 inhibitor. Homology with deoxyribonuclease I (англ.) // Journal of Experimental Medicine : journal. — Rockefeller University Press, 1988. — Vol. 168, no. 5. — P. 1767—1779. — doi:10.1084/jem.168.5.1767. — PMID 3263467. — PMC 2189114.
• Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., et al. Molecular analysis of the third allele of human deoxyribonuclease I polymorphism (англ.) // Ann. Hum. Genet. : journal. — 1995. — Vol. 59, no. Pt 2. — P. 139—147. — doi:10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x. — PMID 7625762.
• Yasuda T., Kishi K., Yanagawa Y., Yoshida A. Structure of the human deoxyribonuclease I (DNase I) gene: identification of the nucleotide substitution that generates its classical genetic polymorphism (англ.) // Ann. Hum. Genet. : journal. — 1995. — Vol. 59, no. Pt 1. — P. 1—15. — doi:10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x. — PMID 7762978.
• Yasuda T., Nadano D., Iida R., et al. Chromosomal assignment of the human deoxyribonuclease I gene, DNASE 1 (DNL1), to band 16p13.3 using the polymerase chain reaction (англ.) // Cytogenetic and Genome Research : journal. — Karger Publishers, 1995. — Vol. 70, no. 3—4. — P. 221—223. — doi:10.1159/000134038. — PMID 7789176.
• Yasuda T., Nadano D., Takeshita H., et al. The molecular basis for genetic polymorphism of human deoxyribonuclease I: identification of the nucleotide substitution that generates the fourth allele (англ.) // FEBS Lett. : journal. — 1995. — Vol. 359, no. 2—3. — P. 211—214. — doi:10.1016/0014-5793(95)00037-A. — PMID 7867802.
• Yasuda T., Nadano D., Tenjo E., et al. Genotyping of human deoxyribonuclease I polymorphism by the polymerase chain reaction (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1996. — Vol. 16, no. 10. — P. 1889—1893. — doi:10.1002/elps.11501601310. — PMID 8586059.
• Iida R., Yasuda T., Takeshita H., et al. Identification of the nucleotide substitution that generates the fourth polymorphic site in human deoxyribonuclease I (DNase I) (англ.) // Hum. Genet. : journal. — 1996. — Vol. 98, no. 4. — P. 415—418. — doi:10.1007/s004390050231. — PMID 8792814.
• Iida R., Yasuda T., Aoyama M., et al. The fifth allele of the human deoxyribonuclease I (DNase I) polymorphism (англ.) // Electrophoresis : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 11. — P. 1936—1939. — doi:10.1002/elps.1150181108. — PMID 9420147.
• Yasuda T., Takeshita H., Iida R., et al. A new allele, DNASE1*6, of human deoxyribonuclease I polymorphism encodes an Arg to Cys substitution responsible for its instability (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — 1999. — Vol. 260, no. 1. — P. 280—283. — doi:10.1006/bbrc.1999.0900. — PMID 10381379.
• Oliveri M., Daga A., Cantoni C., et al. DNase I mediates internucleosomal DNA degradation in human cells undergoing drug-induced apoptosis (англ.) // Eur. J. Immunol. : journal. — 2001. — Vol. 31, no. 3. — P. 743—751. — doi:10.1002/1521-4141(200103)31:3<743::AID-IMMU743>3.0.CO;2-9. — PMID 11241278.
• Otterbein L.R., Graceffa P., Dominguez R. The crystal structure of uncomplexed actin in the ADP state (англ.) // Science : journal. — 2001. — Vol. 293, no. 5530. — P. 708—711. — doi:10.1126/science.1059700. — PMID 11474115.
• Yasutomo K., Horiuchi T., Kagami S., et al. Mutation of DNASE1 in people with systemic lupus erythematosus (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2001. — Vol. 28, no. 4. — P. 313—314. — doi:10.1038/91070. — PMID 11479590.
• Ballweber E., Galla M., Aktories K., et al. Interaction of ADP-ribosylated actin with actin binding proteins (англ.) // FEBS Lett. : journal. — 2001. — Vol. 508, no. 1. — P. 131—135. — doi:10.1016/S0014-5793(01)03040-X. — PMID 11707283.
• Tsutsumi S., Kaneko Y., Asao T., et al. DNase I is present in the chief cells of human and rat stomachs (англ.) // Histochem. J. : journal. — 2002. — Vol. 33, no. 9—10. — P. 531—535. — doi:10.1023/A:1014999624430. — PMID 12005024.