REBASE (от англ. Restriction Enzyme Database) — база данных, содержащая информацию об эндонуклеазах рестрикции, ДНК-метилтрансферазах и других компонентах систем рестрикции-модификации[1]. REBASE содержит обширный набор ссылок, сайтов узнавания и расщепления, последовательностей и структур, а также информацию о коммерческой доступности каждого фермента. REBASE является одной из старейших биологических баз данных, она ведёт свои корни из коллекции рестриктаз собранной Ричардом Робертсом ещё до 1980 года[2]. C того времени в журнале Nucleic Acids Research регулярно публикуются описания этой базы данных[3][4].
REBASE | |
---|---|
Содержимое | |
Описание | База данных компонентов систем рестрикции-модификации |
Организмы | В основном прокариоты |
Контакты | |
Лаборатория | New England Biolabs |
Авторы | Ричард Робертс |
Оригинальная публикация | PMID 19846593 |
Дата выпуска | 31.01.2011 |
Доступность | |
Сайт | rebase.neb.com |
URL для загрузки | ftp.neb.com |
Прочее | |
Частота релизов | Ежемесячно |
Курирование | Да |
См. также
правитьСсылки
править- ↑ Roberts R.J., Vincze T., Posfai J., Macelis D. REBASE — a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes (англ.) // Nucleic Acids Res. — 2010. — Vol. 38, no. Database issue. — P. D234—D236. — doi:10.1093/nar/gkp874. — PMID 19846593.
- ↑ Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1980. — Vol. 8, no. 1. — P. r63—r80. — doi:10.1093/nar/8.1.197-d. — PMID 6243774.
- ↑ Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1982. — Vol. 10, no. 5. — P. r117—r144. — doi:10.1093/nar/10.5.1770. — PMID 6280143.
- ↑ Roberts R.J., Macelis D. REBASE — restriction enzymes and methylases (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1993. — Vol. 21, no. 13. — P. 3125—3137. — doi:10.1093/nar/21.13.3125. — PMID 8392714.
Внешние ссылки
править- http://rebase.neb.com Архивная копия от 16 февраля 2015 на Wayback Machine