REBASE (база данных)

REBASE (от англ. Restriction Enzyme Database) — база данных, содержащая информацию об эндонуклеазах рестрикции, ДНК-метилтрансферазах и других компонентах систем рестрикции-модификации[1]. REBASE содержит обширный набор ссылок, сайтов узнавания и расщепления, последовательностей и структур, а также информацию о коммерческой доступности каждого фермента. REBASE является одной из старейших биологических баз данных, она ведёт свои корни из коллекции рестриктаз собранной Ричардом Робертсом ещё до 1980 года[2]. C того времени в журнале Nucleic Acids Research регулярно публикуются описания этой базы данных[3][4].

REBASE
Изображение логотипа
Содержимое
Описание База данных компонентов систем рестрикции-модификации
Организмы В основном прокариоты
Контакты
Лаборатория New England Biolabs
Авторы Ричард Робертс
Оригинальная публикация PMID 19846593
Дата выпуска 31.01.2011
Доступность
Сайт rebase.neb.com
URL для загрузки ftp.neb.com
Прочее
Частота релизов Ежемесячно
Курирование Да

См. также

править

Ссылки

править
  1. Roberts R.J., Vincze T., Posfai J., Macelis D. REBASE — a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes (англ.) // Nucleic Acids Res. — 2010. — Vol. 38, no. Database issue. — P. D234—D236. — doi:10.1093/nar/gkp874. — PMID 19846593.
  2. Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1980. — Vol. 8, no. 1. — P. r63—r80. — doi:10.1093/nar/8.1.197-d. — PMID 6243774.
  3. Roberts R.J. Restriction and modification enzymes and their recognition sequences (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1982. — Vol. 10, no. 5. — P. r117—r144. — doi:10.1093/nar/10.5.1770. — PMID 6280143.
  4. Roberts R.J., Macelis D. REBASE — restriction enzymes and methylases (англ.) // Nucleic Acids Res. — 1993. — Vol. 21, no. 13. — P. 3125—3137. — doi:10.1093/nar/21.13.3125. — PMID 8392714.

Внешние ссылки

править