Дельта-вариант SARS-CoV-2

(перенаправлено с «Дельта-штамм SARS-CoV-2»)

Дельта-вариант SARS-CoV-2 (штамм B.1.617.2[1]) — один из вариантов коронавируса SARS-CoV-2, возбудителя COVID-19, относящийся к линии B.1.617. Впервые обнаружен и описан в Индии[2].

Передача происходит в разных возрастных группах, включая лиц от 12 до 20 лет[3]. Инкубационный период составляет не 3—7 дней, а 1—3 дня[4]. Также отмечается повышенная по сравнению с другими штаммами вирусная нагрузка[4]. Период выведения возбудителя из организма составляет 13—15 дней, в то время как для других[каких?] вариантов он составляет 7—9 дней[4].

Вызывает простудные симптомы в тяжелой форме, включая недомогание, повышенную температуру, мигрень (головную боль), боль в горле, кашель и ринит[3][5]. Риск госпитализации по сравнению с альфа-вариантом выше в 1,85 раза[3].

По данным на конец декабря 2021 года, вариант дельта быстро вытеснялся омикрон-вариантом в тех странах, где последний начал распространяться[6] (в частности, так происходило в Дании, Норвегии, Великобритании и США)[7].

Изменения вируса

править

Характерной особенностью варианта дельта является аминокислотная замена P681R в S-белке[англ.], благодаря которой вирус стал более заразным[2].

14 июня 2021 года в Индии был обнаружен мутировавший вариант B.1.617.2, который известен как вариант AY.1 или «дельта плюс»[8]. «Дельта плюс» отличается наличием в S-белке мутации K417N, которая способна снижать активность антител у переболевших и вакцинированных людей[9]. Минздрав Индии назвал три отличительных признака «дельты плюс»: повышенная контагиозность, усиленная способность связываться с рецепторами клеток легких и потенциальная устойчивость к терапии моноклональными антителами[10][источник не указан 1160 дней]. Благодаря этой замене вирус быстрее связывается с клетками легких человека. Имеется предположение, что K417N также помогает вирусу уклоняться от нейтрализующих антител. Схожие мутации имеются у вариантов бета и гамма.[11]

В октябре 2021 года при анализе эволюции варианта дельта был обнаружен новый вариант AY.4.2, обладающий большей контагиозностью, чем предыдущие: на 10—15 % заразнее варианта дельта. В Великобритании на его долю приходился каждый десятый случай заражения коронавирусом в стране[12][13].

Распространение

править

К началу июля 2021 года были зафиксированы случаи заражения дельта-вариантом в 98 странах как с высоким, так и с низким уровнем вакцинации населения, во многих странах он становился доминантным[14].

В России

править

В России первые случаи инфекции вариантом дельта были зафиксированы в апреле 2021 года, а в июне их распространённость составила 41 %.[15]. По информации на середину июня 2021 года, доля дельта-варианта (B.1.617 по классификации PANGO) за предшествующие четыре недели составила в России 63,2 %, о чём указано на международной платформе GISAID[англ.], которая обеспечивает открытый доступ к геномным последовательностям вирусов гриппа и коронавируса и географическим данным распространения вариантов коронавируса. Аналогичные данные можно было найти в базе проекта Бернского и Базельского университетов Швейцарии CoVariants, где указывалось, что во второй половине мая 2021 года доля дельта-варианта для секвенированных образцов из России составляла 66 %[16]. По данным Российского консорциума по секвенированию геномов SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI), дельта-вариант занимал чуть больше половины (52 %) в образцах, полученных в Санкт-Петербурге в мае 2021 года, а в июне 2021 года — более 90 %[17][18].

По Санкт-Петербургу дельта-вариант распространился за 2 месяца и в конце второй декады июня 2021 года потеснил вариант альфа. Санкт-Петербург — единственный регион России с достаточными данными по секвенированию коронавирусов[2].

29 июня 2021 года Роспотребнадзор заявил об обнаружении в России варианта «дельта-плюс».[19]

13 июля 2021 года главный санитарный врач Ростовской области заявил, что за предшествующие 3 недели специалисты Роспотребнадзора выявляют исключительно дельта-вариант, при этом в 90 % случаев его носители не выезжали за границу. Кроме того, этот вариант выявляли у граждан, прибывающих из Таджикистана, Узбекистана и Киргизии[20].

Примечания

править
  1. ВОЗ решила называть штаммы коронавируса буквами греческого алфавита. — «Варианты коронавируса COVID-19 станут обозначать буквами греческого алфавита, чтобы не дискриминировать страны, где эти штаммы обнаружили впервые, и для удобства произношения в ненаучном разговоре, сообщила Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ). В соответствии с новой системой, «британский» штамм коронавируса B.1.1.7 получит название «Альфа», вариант B.1.351, впервые обнаруженный в ЮАР, станет «Бетой», а бразильский P.1 — «Гаммой». Два подвида «индийского» штамма коронавируса — B.1.617.2 и B.1.617.1 — назовут «Дельтой» и «Каппой» соответственно.» Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 28 июня 2021 года.
  2. 1 2 3 Александр Ершов. Рассказываем все, что известно ученым о варианте дельта, из-за которого Россия переживает небывалую вспышку ковида. Meduza (19 июня 2021). Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 29 июня 2021 года.
  3. 1 2 3 Названы группы населения, которые в первую очередь поражает дельта-штамм коронавируса. Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 29 июня 2021 года.
  4. 1 2 3 Эпидемиолог из КНР назвал три главных особенности штамма «Дельта» COVID-19. Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 29 июня 2021 года.
  5. Германия: Симптомы индийского штамма коронавируса отличаются от типичных. Дата обращения: 29 июня 2021. Архивировано 29 июня 2021 года.
  6. Анастасия Селиванова. Попова предсказала вытеснение «дельта»-штамма «омикроном» Архивная копия от 29 декабря 2021 на Wayback Machine // Российская газета, 28.12.2021.
  7. Эксперт сообщил, что новый штамм «омикрон» начинает очень быстро вытеснять «дельту» Архивная копия от 26 декабря 2021 на Wayback Machine // ТАСС, 26.12.2021.
  8. Sharma, Milan New 'Delta Plus' variant of SARS-CoV-2 identified; here's what we know so far (англ.). India Today. Дата обращения: 16 июня 2021. Архивировано 17 июня 2021 года.
  9. В Индии выявили новый штамм коронавируса «дельта плюс» Архивная копия от 23 июня 2021 на Wayback Machine, 21 июня 2021
  10. В Индии обнаружили новый сверхзаразный штамм Covid Архивная копия от 25 июня 2021 на Wayback Machine, 24.06.2021
  11. "Дельта плюс" вызывает все больше опасений. Что мы знаем об этом штамме коронавируса? Дата обращения: 30 июля 2021. Архивировано 30 июля 2021 года.
  12. New Delta descendant may be more infectious than its ancestor. Дата обращения: 23 октября 2021. Архивировано 23 октября 2021 года.
  13. В Великобритании раскрыли подробности о новом штамме коронавируса Архивная копия от 23 октября 2021 на Wayback Machine, 20 октября 2021
  14. ВОЗ зафиксировала штамм COVID «дельта» в 98 странах Архивная копия от 9 июля 2021 на Wayback Machine // Интерфакс, 02.07.2021.
  15. Штаммы коронавируса COVID-19, выявленные в России — РИА Новости, 21.10.2021. Дата обращения: 2 сентября 2022. Архивировано 2 сентября 2022 года.
  16. Доля индийского варианта коронавируса в России достигла 63 % Архивная копия от 16 июня 2021 на Wayback Machine // Медвестник, 16.06.2021
  17. Заразительный пример: какова роль индийского штамма в росте заболеваемости Архивная копия от 18 июня 2021 на Wayback Machine // Известия, 16.06.2021.
  18. Индийский штамм нашли в 90 % исследованных российских образцов коронавируса Архивная копия от 18 июня 2021 на Wayback Machine // Известия, 16.06.2021.
  19. В России обнаружили штамм коронавируса "дельта плюс". Дата обращения: 20 июля 2021. Архивировано 20 июля 2021 года.
  20. Назван российский регион, где выявили исключительно «дельта»-штамм коронавируса. Дата обращения: 13 июля 2021. Архивировано 13 июля 2021 года.